Yürütme ve yargı organlarının ilişkilerinin, kuvvetler ayrılığı prensibi açısından değerlendirilmesi önemlidir. Yürütme, vergi hukuku alanında vergilerin yasallığı ilkesinin mevcudiyetine dolayısıyla düzenleyici işlem yapabilme olanaklarının sınırlı olmasına karşın vergilendirmeye ilişkin pek çok noktada etkin bir kontrolün arayışındadır. Bunun yanında yargı, idarenin eylem ve işlemlerini ve icrailik niteliği taşıyan uygulamayı gösteren metinlerini de denetlemektedir. Bu noktada yürütme organı ile yargı organlarının yorumları çatışabilmektedir. Çatışma, yürütme organının yetkisi aşarak vergilerin yasallığı ilkesine aykırı düzenlemeler getirdiği, yargı organlarının ise yerindelik denetimi yaptığı iddiasında düğümlenmektedir. Katma değer vergisinin konusu söz konusu olduğunda, bu çatışma somut olarak görülebilmektedir.
Çalışmada yürütme ve yargı organlarının katma değer vergisinin konusu özelinde karşı karşıya geldiği durumlar irdelenmektedir. Böylelikle yasama organının belirlediği katma değer vergisinin konusunun, yürütme ve yargı organları arasında ne tür görüş farklılıklarına yol açtığı açıkça görülebilecektir.